Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swap70Q6A028 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swap70Q6A028 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms