Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CilpQ66K08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CilpQ66K08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CilpQ66K08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms