Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zeb1Q64318 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Zeb1Q64318 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Zeb1Q64318 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms