Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfdp2Q64163 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfdp2Q64163 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfdp2Q64163 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfdp2Q64163 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfdp2Q64163 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms