Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pan3Q640Q5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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