Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa17Q64016 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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Defa17Q64016 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa17Q64016 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Defa17Q64016 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa17Q64016 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa17Q64016 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms