Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a5Q63ZW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a5Q63ZW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms