Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd33Q63994 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms