Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CochQ62507 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CochQ62507 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CochQ62507 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CochQ62507 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CochQ62507 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CochQ62507 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CochQ62507 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CochQ62507 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CochQ62507 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CochQ62507 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CochQ62507 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CochQ62507 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CochQ62507 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CochQ62507 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CochQ62507 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CochQ62507 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CochQ62507 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CochQ62507 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms