Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vat1Q62465 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms