Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CcncQ62447 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CcncQ62447 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CcncQ62447 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CcncQ62447 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms