Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ss18Q62280 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ss18Q62280 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ss18Q62280 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms