Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sprr1aQ62266 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sprr1aQ62266 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms