Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Six1Q62231 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Six1Q62231 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six1Q62231 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms