Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp1Q62209 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms