Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PtprrQ62132 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PtprrQ62132 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PtprrQ62132 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprrQ62132 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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PtprrQ62132 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprrQ62132 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms