Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifi47Q61635 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifi47Q61635 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms