Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccne1Q61457 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne1Q61457 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne1Q61457 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms