Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna2Q61301 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna2Q61301 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms