Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf9Q61179 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf9Q61179 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf9Q61179 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms