Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf235Q61116 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf235Q61116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms