Protein–RNA interactions for Protein: Q61097

Ksr1, Kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ksr1Q61097 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ksr1Q61097 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ksr1Q61097 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ksr1Q61097 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ksr1Q61097 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ksr1Q61097 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms