Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CybbQ61093 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CybbQ61093 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CybbQ61093 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CybbQ61093 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CybbQ61093 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CybbQ61093 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CybbQ61093 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CybbQ61093 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms