Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc1Q61056 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms