Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift20Q61025 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms