Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna1Q60960 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms