Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk3Q5XJV6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk3Q5XJV6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmtk3Q5XJV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmtk3Q5XJV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk3Q5XJV6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmtk3Q5XJV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmtk3Q5XJV6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms