Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms