Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms