Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf1Q5U4C3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf1Q5U4C3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms