Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NacadQ5SWP3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NacadQ5SWP3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NacadQ5SWP3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NacadQ5SWP3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NacadQ5SWP3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
NacadQ5SWP3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms