Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d9bQ5SVR0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d9bQ5SVR0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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