Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL9

Prl2c1, Growth hormone d22, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl2c1Q5SVL9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prl2c1Q5SVL9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prl2c1Q5SVL9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl2c1Q5SVL9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms