Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynrgQ5SV85 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms