Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Sco1Q5SUC9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Sco1Q5SUC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sco1Q5SUC9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms