Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp18Q5SSI6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms