Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlha9Q5RJB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlha9Q5RJB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms