Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I3

Trav7-2, T cell receptor alpha variable 7-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav7-2Q5R1I3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav7-2Q5R1I3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms