Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp13Q5BKP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms