Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt35Q497I4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt35Q497I4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms