Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx25Q3ZT31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms