Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap1-4Q3V2D6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms