Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms