Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Usp48Q3V0C5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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