Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms