Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms