Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkl5Q3UTQ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdkl5Q3UTQ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms