Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhdc9Q3USL1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhdc9Q3USL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhdc9Q3USL1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms