Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf48Q3US17 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf48Q3US17 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms