Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TceancQ3US16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TceancQ3US16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms